Dinâmica da Busca de Fatores de Transcrição em Cadeias de DNA com uma Abordagem Livre de Malha

Luiz Otávio R. A. Sereno, Ana Paula de Paiva Pereira, João Paulo Oliveira Fernandes, Allbens Atman Picardi Faria, José Luiz Acebal

Resumo


Os fatores de transcrição (FTs) são proteı́nas especializadas em localizar um sı́tio-alvo em uma molécula de DNA, permitindo ou inibindo a ação de cópia do acido desoxirribonucleico (DNA) na célula dos seres vivos. A compreensão da dinâmica desta função é importante por que, por exemplo, um vı́rus que invada uma célula saudável pode ter seu DNA impedido de se replicar pela ação de um FT. Este tema é estudado há algumas décadas, e conta diversos modelos teóricos e computacionais que tentam simular esta busca. Em células procariontes, a busca é realizada a partir de um ponto do citoplasma até um sı́tio-alvo localizado na cadeia de DNA. Em contraste com a maior parte dos trabalhos já realizados, é suposto neste trabalho que o movimento realizado pelas proteı́nas se dá por um processo conhecido como difusão anômala. A fim de poder contemplar maior complexidade e para possibilitar a elaboração de um modelo matemático, é proposto um modelo livre de malha. Nas simulações analisamos como os FTs se posicionam após um certo tempo verificando que a busca se torna mais eficiente quando realizada segundo o modelo de difusão facilitada no qual são alternadas buscas em 3D pelo citoplasma e em 1D pela cadeia de DNA.


Palavras-chave


DNA, Fatores de Transcrição, Livre de Malha

Texto completo:

PDF


DOI: https://doi.org/10.5540/03.2018.006.02.0270

Apontamentos

  • Não há apontamentos.


SBMAC - Sociedade de Matemática Aplicada e Computacional
Edifício Medical Center - Rua Maestro João Seppe, nº. 900, 16º. andar - Sala 163 | São Carlos/SP - CEP: 13561-120
 


Normas para publicação | Contato