Uma abordagem do algoritmo do montador de DNA SOAPdenovo

Evaldo B. Costa, Gabriel P. Silva, Marcello G. Teixeira

Resumo


Em bioinformática, existem vários programas disponíveis para montagem de sequência de DNA [1]. Isso geralmente é uma tarefa muito demorada, uma vez que essas sequências de DNA podem ser muito longas e complexas [2]. A escolha correta de um montador implica diretamente na quantidade de recursos computacionais utilizados para este processo. Neste trabalho, faremos uma abordagem do novo algoritmo utilizado no montador SOAPdenovo2.

Palavras-chave


Montador, DNA, SOAPdenovo1, SOAPdenovo2, Algoritmo, desempenho

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DOI: https://doi.org/10.5540/03.2015.003.02.0105

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