Uma abordagem do algoritmo do montador de DNA SOAPdenovo

Autores

  • Evaldo B. Costa
  • Gabriel P. Silva
  • Marcello G. Teixeira

DOI:

https://doi.org/10.5540/03.2015.003.02.0105

Palavras-chave:

Montador, DNA, SOAPdenovo1, SOAPdenovo2, Algoritmo, desempenho

Resumo

Em bioinformática, existem vários programas disponíveis para montagem de sequência de DNA [1]. Isso geralmente é uma tarefa muito demorada, uma vez que essas sequências de DNA podem ser muito longas e complexas [2]. A escolha correta de um montador implica diretamente na quantidade de recursos computacionais utilizados para este processo. Neste trabalho, faremos uma abordagem do novo algoritmo utilizado no montador SOAPdenovo2.

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Publicado

2015-11-18

Edição

Seção

Modelagem Matemática e Aplicações