Álgebra Geométrica Conforme aplicada à atualização de estruturas 3D de proteínas

Authors

  • Alysson Matos
  • Carlile Lavor

Abstract

Proteínas são macromoléculas muito importantes para os organismos vivos, pois estão presentes em diversos processos biológicos essenciais, como transporte de substâncias, defesa do organismo, entre muitos outros [1]. O formato tridimensional de uma proteína está intrinsecamente relacionado à sua função. É comum em química computacional a necessidade de calcular diversas vezes a atualização da estrutura 3D de uma proteína [2]. Por isso, nosso objetivo é estudar como a Álgebra Geométrica (AG) pode ser utilizada lidar com mudanças conformacionais de proteínas. [...]

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Author Biographies

Alysson Matos

IMECC/UNICAMP, Campinas, SP

Carlile Lavor

IMECC/UNICAMP, Campinas, SP

References

David Nelson e Michael Cox. Principles of Biochemistry. W.H. Freeman, New York, 2008.

Vicky Choi. “On updating torsion angles of molecular conformations”. Em: Journal of chemical, information and modeling, ACS Publications 46.1 (2006), pp. 438–444.

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Jesus Marcos Camargo. “Geometria de proteínas no espaço conforme”. Tese de doutorado. Campinas: Universidade Estadual de Campinas, 2021.

Alysson Matos de Souza. “Álgebra Geométrica Conforme aplicada à atualização de estruturas 3D de proteínas”. Dissertação de mestrado. Campinas: Universidade Estadual de Campinas, 2023.

Irina Kufareva e Ruben Abagyan. “Methods of protein structure comparison”. Em: Methods Mol Biol 857 (2012), pp. 231–257.

Published

2023-12-18